R/gg_temp_env.R
gg_temp_env.Rd
Produire le graphique de l'évolution temporelle de facteurs environnementaux moyens comparés entre les sites de présence et d'absence des espèces
gg_temp_env(
df,
parametres = NA,
log_y = c("surface_bv", "distance_source", "pente", "largeur"),
annee_debut = 1995,
annee_fin = NA,
y_libre = FALSE,
coul_pres = "blue",
coul_abs = "red"
)
Le dataframe contenant les données avec les variables presence, parametre, valeur_parametre, annee
Vecteur caractères. Les paramètre (ex : "altitude") représentés.
Vecteur caractères. Les paramètre (ex : "altitude") représentés en échelle log. Par défaut, sa valeur est c('surface_bv', 'distance_source', 'pente', 'largeur'), ce qui correspond aux paramètres dont la distribution de rapproche d'une log-normale.
Entier. Année mini à représenter.
Entier. Année maxi à représenter.
TRUE/FALSE (valeur par défaut). Les axes des ordonnées peuvent (TRUE) différer selon les espèces, ce qui permet un "zoom", ou bien être les mêmes pour toutes, ce qui permet de les comparer les unes aux autres.
Caractère. Couleur ou code hexadécimal couleur pour les présences.
Caractère. Couleur ou code hexadécimal couleur pour les absences.
Une liste dont les éléments sont des graphiques ggplot2 (un par paramètre).
if (FALSE) { # \dontrun{
mes_graphiques <- gg_temp_env(df = mon_df, log_y = c('surface_bv', 'distance_source'))
mes_graphiques[[1]]
} # }