Produire le graphique des distributions comparées des paramètres environnementaux entre les sites de présence et d'absence d'une espèce.

Produire le graphique des distributions comparées des paramètres environnementaux entre les sites de présence et d'absence d'une espèce.

gg_density_env_esp(
  df,
  espece,
  parametres = NA,
  quantile_max = 0.99,
  log = c("surface_bv", "distance_source", "pente", "largeur"),
  coul_pres = "blue",
  coul_abs = "red"
)

Arguments

df

Le dataframe contenant les données environnementales et les présences / absences des espèces, par opération, avec les champs parametre, valeur_parametre, esp_code_alternatif, presence.

espece

Caractère. Code trois lettres de l'espèce (ex : "BRO" pour le brochet).

parametres

Vecteur caractère listant des paramètres environnementaux à représenter. Par défaut toutes les modalités de la variale "parametre" sont représentées.

quantile_max

Numérique sur l'intervalle 0-1. Sert à exclure les valeurs extrêmes si nécessaire pour les représentations graphiques. Par exemple quantile_max = 0.99 signifie que les 1p100 des valeurs les plus élevées sont exclues.

log

Vecteur caractère listant celles des variables environnementales pour lesquelles l'axe des absisses est en échelle log. Par défaut ce sont les variables surface_bv, distance_source, pente et largeur.

coul_pres

Caractère. Couleur ou code hexadécimal couleur pour les présences.

coul_abs

Caractère. Couleur ou code hexadécimal couleur pour les absences.

Value

Une liste contenant un graphique par paramètre environnemental.

Examples

if (FALSE) { # \dontrun{
mes_graphiques <- gg_density_env_esp(df = mon_df, espece = "BRO", quantile_max = 0.95,
log = c('surface_bv', 'distance_source'))
mes_graphiques[[1]]
} # }